Одним из наиболее важных направлений в деятельности комиссии является контроль за ходом выполнения совместных программ экологической направленности, заявил председатель Комиссии по вопросам экологии, природопользования и ликвидации последствий аварий Парламентского собрания Союза Беларуси и России Владимир Адашкевич. В частности, за время ее существования было рассмотрено более 60вопросов. Так, по инициативе комиссии и при активном участии депутатов в 1998-2001 годах была реализована первая совместная программа преодоления последствий чернобыльской катастрофы. В программу были включены работы по созданию материально-технической базы единой системы специализированной медицинской помощи, выполнению научно-практических работ в области здравоохранения, сельского и лесного хозяйства, мониторинга окружающей среды. Общий объем финансирования мероприятий данной программы составил 344,8 млн. рублей, в том числе 290,5 млн. рублей капитальных вложений.

В 1998-2001 году был успешно завершен первый этап союзной программы «Совершенствование и развитие единой технологии получения, сбора, анализа и прогноза, хранения и распространения гидрометеорологической информации и данных о загрязнении природной среды». В рамках данной программы из бюджета союзного государства было освоено 14,5 млн. рублей. На реализацию Программы совместной деятельности по преодолению последствий чернобыльской катастрофы в рамках Союзного государства на 2002-2005 из бюджета Союзного государства направлено 980 млн. рублей, выделенные средства освоены полностью. Заказчиками и исполнителями проведена значительная работа по развитию материально-технической базы учреждений здравоохранения и фармацевтической промышленности Беларуси и России, оснащению оборудованием специализированных и научных учреждений Беларуси и России, уточнению и оценке дозовых нагрузок пострадавшего населения, совершенствованию и развитию единой системы радиационного мониторинга и контроля, разработке единых нормативных правовых документов, регулирующих радиационно-гигиенические и другие аспекты безопасного проживания граждан на радиоактивно загрязненных территориях, разработке и внедрению современных методов и технологий, обеспечивающих снижение содержания радионуклидов в пищевой продукции, разработке унифицированных методических указаний, руководств и других материалов по ведению агропромышленного и лесного хозяйства на радиоактивно загрязненных территориях, совершенствованию информационных технологий по работе с населением радиоактивно загрязненных территорий.